Les données du STOC (Suivi Temporel des Oiseaux Communs, un observatoire de Vigie-Nature), collectées par des ornithologues amateurs et professionnels, ont permis aux scientifiques de produire des indicateurs annuels sur l'abondance des espèces dans différents habitats (forêt, ville, campagne etc.).
Les relevés effectués en milieu rural mettent en évidence une diminution des populations d'oiseaux (l’Alouette des champs, la Fauvette grisette ou le Bruant ortolan par exemple) vivants en milieu agricole depuis les années 1990. Leurs populations se sont réduites en moyenne d’un tiers en 15 ans et les chiffres montrent que ce déclin s’est encore intensifié en 2016 et 2017.

Indicateurs STOC 2017, les pourcentages correspondent à l'évolution moyenne des populations de 1989 à 2017.

Ces résultats nationaux sont confirmés par une seconde étude menée à une échelle locale sur la Zone atelier « Plaine & Val de Sèvre » portée par le CNRS. Depuis 1995, des chercheurs du Centre d’études biologiques de Chizé suivent chaque année, dans les Deux-Sèvres, 160 zones de 10 hectares d’une plaine céréalière typique des territoires agricoles français. En 23 ans, toutes les espèces d'oiseaux de plaine ont vu leurs populations fondre : l’alouette perd plus d'un individu sur trois (-35%) ; avec huit individus disparus sur dix, les perdrix sont presque décimées.

Ce déclin frappe toutes les espèces d’oiseaux en milieu agricole, aussi bien les espèces dites spécialistes - fréquentant prioritairement ce milieu -, que les espèces dites généralistes - retrouvées dans tous les types d’habitats, agricoles ou non. Or d’après les données issues du STOC, les espèces généralistes ne déclinent pas à l’échelle nationale, la diminution constatée est donc propre au milieu agricole